本館於民國八十三年十月十六日隨慈濟醫學院創校成立，臨時館址位於行政大樓一樓學務處及人事會計室現址，面積均110坪﹙363平方公尺﹚，館藏資料以醫護及生命科學為主。 
   民國八十五年九月十三日新建館舍完成啟用，為地上二層之現代化圖書館，面積約1188坪﹙3927平方公尺﹚，館藏設備由臨時館址遷入現址；為配合學校增設人文社會學院及預計九十學年改制為大學，本館加強人文社會科學及生命科學各類資料之蒐藏，並規畫擴增原有館舍面積，以容納快速增加之館藏及提供慈濟志業教職生及社區民眾更寬敞舒適空間。 
   民國八十九年二月完成二樓書庫閱覽區及視聽資料室擴建挪架，同年七月接著完成地下室書庫閱覽區之擴建挪架，總面積約7490平方公尺。 
   民國九十年八月慈濟醫院圖書館將館藏圖書及過期期刊挪至本館典藏，方便志業體讀者使用各類資料。 
   民國九十一年九月，與慈濟科技大學圖書館共建自動化主機，順利將三校一院之圖書館自動化系統與館藏整合於同一主機。 
   民國九十六年九月，增設人文社會學院分館，面積約6,827平方公尺。兩館館舍總面積共14,317平方公尺，閱覽席次共有622席。

館長： 劉嘉卿  助理教授 分機2616 / 2617 組    別 服 務 項 目 聯 絡 方 式 採錄編目組 紙本圖書及視聽資料之目錄蒐集、採購、驗收及經費核銷 圖書及視聽資料之分類與編目 館藏書目維護 讀者薦購處理與回覆 受理緊急採購紙本圖書及視聽資料 製作紙本圖書及視聽資料之相關統計報表 贈書、謝函處理 不定期辦理二手書募集與贈送 組長 蘇佩芬 分機1423 組員 王佩儀 分機1424 組員 林永琇 分機1425 書記 江靜慧 分機1431 典藏閱覽組 書架、視聽資料室之整理維護 管理及受理研究小間、討論室、團體視聽室申請借用 報紙收藏 受理館藏之借還、預約、續借 教授指定參考資料整理及借閱服務 處理外借資料逾期罰款及遺失資料賠償手續 受理申請借書證及讀者檔之維護 閱覽區管理維護 影印及其他收費服務業務 受理離校手續 館藏盤點與報銷淘汰 門禁系統資料維護 組長 楊淑珍 分機1426 組員 王婷儀 分機1426 書記 陳英雄 分機1423 書記 尹培昭 分機1422 約聘 徐和仁 分機1422 書記 江家儀 分機 1471﹙人社分館﹚ 參考資訊組 圖書館全球資訊網站之建立及維護 圖書館資源利用文件及手冊之編修 解答讀者有關資料檢索之各種問題 電子資源年度預算編列及管理 處理電子資料庫的增、刪、續訂作業 處理中、西文電子書採購及管理事宜 電子資源年度使用統計整理 公佈欄及讀者問題管理 網路資源之徵集與利用推廣 博碩士論文抄襲比對、審核、徵集與回溯建檔 指導並推廣讀者使用館內各項資源 館內各電腦主機及系統之維護 二手書交易平台維護及管理事宜 機構典藏系統建檔及管理事宜 組長 黃順發 分機1428/1429 組員 李佳陵 分機1427/1429 組員 江智謙 分機1470﹙人社分館﹚ 非書資料組 期刊之採購、登記、催查、裝訂、編目及建檔 製作期刊經費統計表及使用統計表 館際合作業務及文獻傳遞服務 慈濟醫院移送期刊登錄建檔 組長 陳啟維 分機1420  組員 林怡菁 分機1424 書記 曾繼鋒